分析各选项如下：

A. 不同类型指令的 CPI 可能不一样

正确。CPI（Clock Cycles Per Instruction，每条指令的时钟周期数）因指令类型而异。例如，算术逻辑指令（如加法）可能只需 1 个周期，而访存指令（如 Load/Store）可能需要多个周期（涉及内存访问延迟），因此不同指令的 CPI 不同。

B. 程序的 CPI 与 Cache 缺失率无关

错误。Cache 缺失率会直接影响指令或数据的访问时间。当 Cache 缺失时，需要从主存读取数据，这会增加额外的时钟周期，导致平均 CPI 上升。因此，程序的 CPI 与 Cache 缺失率密切相关。

C. 单周期 CPU 的时钟周期以最耗时指令所用的时间为准

正确。单周期 CPU 中，所有指令均在一个时钟周期内完成，为确保所有指令都能正确执行，时钟周期的时长需以执行时间最长的指令为准（例如访存指令可能比算术指令耗时更长）。

D. 流水线 CPU 的时钟周期以最长流水段所用时间为准

正确。流水线 CPU 的每个流水段在一个时钟周期内完成操作。为保证所有流水段同步工作，时钟周期的时长由耗时最长的流水段决定（即 “瓶颈段”），以确保该段能完成处理，避免流水线阻塞。

答案：B