左对齐使用%-3d就可以啦

#include<stdio.h>
int main()
{
    int n;
    scanf("%d",&n);
    int a[n][n];
    for(int i=0;i<n;i++)
    {
        for(int j=0;j<n;j++)
        {
            a[i][j]=-1;
        }
    }
    int k=2;
    a[0][0]=1;
    int x=0,y=0;
    for(int i=0;i<n;i++)
    {
        for(int j=0;j<n;j++)
        {
            //向下
            while(x+1<n&&a[x+1][y]==-1)
            {
         ...